La sociedad se forja como producto del cambio de modelo empresarial de la Cooperativa Agraria Sintuco Ltda. a sociedad anónima, conforme a lo dispuesto por el D.L. 802. Inicia sus actividades el 11 de marzo de 1997, fecha en que su constitución queda anotada en Registros Públicos, ficha 8127, La Libertad.

El 3 de mayo del 2007, la Corporación Azucarera del Perú S.A. (Coazúcar), subsidiaria del Grupo Gloria, adquirió de Azucagro S.A. el 45,29% de las acciones de Sintuco y en esa misma fecha compró también la mayoría de las acciones del Complejo Agroindustrial Cartavio S.A.A., que tenía el 14,49% de las acciones de Sintuco. De esta manera, el Grupo Gloria pasó a ser titular de 59,8% del capital social de Sintuco.

Como parte del Grupo Gloria, Sintuco provee a Cartavio y Casa Grande de caña de azúcar y avispas para el control de plagas, “producidas” bajo estrictas medidas de control por parte del Servicio Nacional de Sanidad Agraria (SENASA).